From: Pinpointing the vesper bat transposon revolution using the Miniopterus natalensis genome
Classification | Miniopterus natalensis | Myotis lucifugus | E. fuscus | P. parnelli | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Bases | Percentage | Bases | Percentage | Bases | Percentage | Bases | Percentage | |
Transposable elements | 415,627,321 | 23.95Â % | 518,680,444 | 27.50Â % | 478,933,702 | 26.58Â % | 383,285,246 | 24.76Â % |
 Class I Retrotransposons | 388,593,157 | 22.39 % | 424,243,455 | 22.50 % | 383,040,593 | 21.26 % | 346,459,100 | 22.37 % |
Long Terminal Repeats | 69,316,646 | 4.00Â % | 72,931,404 | 3.88Â % | 71,532,426 | 3.97Â % | 68,573,030 | 4.43Â % |
 ERV | 1,092,720 | 0.06 % | 1,038,965 | 0.06 % | 1,149,410 | 0.06 % | 1,499,592 | 0.10 % |
 ERV1 | 23,526,841 | 1.36 % | 28,053,951 | 1.49 % | 26,324,280 | 1.46 % | 19,669,702 | 1.27 % |
 ERV2 | 431,937 | 0.02 % | 7,857,605 | 0.42 % | 4,951,316 | 0.27 % | 391,300 | 0.03 % |
 ERV3 | 41,929,575 | 2.42 % | 34,495,447 | 1.83 % | 37,663,204 | 2.09 % | 45,513,437 | 2.94 % |
 Gypsy | 357,161 | 0.02 % | 220,101 | 0.01 % | 272,666 | 0.02 % | 600,987 | 0.04 % |
 LTR | 1,978,412 | 0.12 % | 1,265,335 | 0.07 % | 1,171,550 | 0.07 % | 898,012 | 0.05 % |
Long INterspersed Elements | 241,612,217 | 13.92Â % | 242,431,627 | 12.85Â % | 210,106,281 | 11.66Â % | 225,554,475 | 14.57Â % |
 L1 | 240,801,801 | 13.88 % | 241,785,916 | 12.82 % | 209,396,239 | 11.63 % | 224,541,665 | 14.51 % |
 L2 | 63,018 | 0.00 % | 42,706 | 0.00 % | 53,584 | 0.00 % | 158,866 | 0.01 % |
Penelope | 3,390 | 0.00Â % | 2,619 | 0.00Â % | 1,994 | 0.00Â % | 3,371 | 0.00Â % |
 R4 | 24,859 | 0.00 % | 14,178 | 0.00 % | 21,390 | 0.00 % | 35,098 | 0.00 % |
 RTE | 467,222 | 0.03 % | 425,242 | 0.02 % | 428,374 | 0.02 % | 431,357 | 0.03 % |
 RTEX | 246,560 | 0.01 % | 156,754 | 0.01 % | 198,740 | 0.01 % | 376,073 | 0.02 % |
 Tx1 | 5,367 | 0.00 % | 4,212 | 0.00 % | 5,960 | 0.00 % | 8,045 | 0.00 % |
Short INterspersed Elements | 77,664,294 | 4.47Â % | 108,880,424 | 5.77Â % | 101,401,886 | 5.63Â % | 52,331,595 | 3.37Â % |
 Unclassified | 141,822 | 0.01 % | 113,971 | 0.01 % | 119,602 | 0.01 % | 197,376 | 0.01 % |
 tRNA | 77,501,269 | 4.46 % | 108,745,685 | 5.76 % | 101,255,190 | 5.62 % | 52,075,143 | 3.36 % |
 7SL | 1,048 | 0.00 % | 1,775 | 0.00 % | 1,914 | 0.00 % | 3,786 | 0.00 % |
 5S | 20,155 | 0.00 % | 18,993 | 0.00 % | 25,180 | 0.00 % | 55,290 | 0.00 % |
Class II DNA transposons | 26,535,664 | 1.53Â % | 91,629,080 | 4.85Â % | 92,568,583 | 5.14Â % | 36,073,984 | 2.34Â % |
 Cut and Paste | 26,433,314 | 1.52 % | 47,434,627 | 2.51 % | 35,693,046 | 1.98 % | 35,940,177 | 2.33 % |
 Kolobok | 10,135 | 0.00 % | 8,065 | 0.00 % | 10,145 | 0.00 % | 16,113 | 0.00 % |
 MuDR | 13,048 | 0.00 % | 12,651 | 0.00 % | 13,221 | 0.00 % | 21,955 | 0.00 % |
 PiggyBac | 366,671 | 0.02 % | 261,766 | 0.01 % | 941,162 | 0.05 % | 117,137 | 0.01 % |
TcMar-Mariner | 7,537,182 | 0.43Â % | 7,941,486 | 0.42Â % | 10,197,575 | 0.57Â % | 11,885,374 | 0.77Â % |
 hAT | 18,506,278 | 1.07 % | 39,210,659 | 2.08 % | 24,530,943 | 1.36 % | 23,899,598 | 1.55 % |
Rolling circle | 102,350 | 0.01Â % | 44,194,453 | 2.34Â % | 56,875,537 | 3.16Â % | 133,807 | 0.01Â % |
 Helitrons | 102,350 | 0.01 % | 44,194,453 | 2.34 % | 56,875,537 | 3.16 % | 133,807 | 0.01 % |
 Unknown | 498,500 | 0.03 % | 2,807,909 | 0.15 % | 3,324,526 | 0.18 % | 752,162 | 0.05 % |